Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHGDHO43175 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHGDHO43175 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms