Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARPC1BO15143 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARPC1BO15143 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms