Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD28O15084 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD28O15084 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms