Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYNMO15061 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNMO15061 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SYNMO15061 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SYNMO15061 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SYNMO15061 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SYNMO15061 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNMO15061 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNMO15061 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNMO15061 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNMO15061 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNMO15061 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNMO15061 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNMO15061 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNMO15061 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNMO15061 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYNMO15061 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYNMO15061 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYNMO15061 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYNMO15061 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYNMO15061 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNMO15061 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms