Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA3EO15041 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms