Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN9O14815 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN9O14815 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms