Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGPSO00116 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPSO00116 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPSO00116 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPSO00116 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPSO00116 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AGPSO00116 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPSO00116 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms