Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
H7C1D1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H7C1D1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
H7C1D1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H7C1D1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
H7C1D1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H7C1D1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
H7C1D1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
H7C1D1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
H7C1D1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
H7C1D1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
H7C1D1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
H7C1D1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
H7C1D1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
H7C1D1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms