Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL2C9JE40 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL2C9JE40 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms