Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
A8MVJ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
A8MVJ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
A8MVJ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
A8MVJ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
A8MVJ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
A8MVJ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
A8MVJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms