Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6L9A6NEM1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLGA6L9A6NEM1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms