Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms