Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MEIS3P1A6NDR6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MEIS3P1A6NDR6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms