Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00862A6NCI5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00862A6NCI5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms