Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3AA6NCI4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3AA6NCI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms