Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HMX2A2RU54 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMX2A2RU54 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMX2A2RU54 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms