Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRGMA1A4Y4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IRGMA1A4Y4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms