Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCP2D1Q9UJQ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCP2D1Q9UJQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2D1Q9UJQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCP2D1Q9UJQ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCP2D1Q9UJQ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms