Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSKIPQ9P0R6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSKIPQ9P0R6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSKIPQ9P0R6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSKIPQ9P0R6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSKIPQ9P0R6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSKIPQ9P0R6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSKIPQ9P0R6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSKIPQ9P0R6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSKIPQ9P0R6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSKIPQ9P0R6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSKIPQ9P0R6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms