Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHP2Q9NX24 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHP2Q9NX24 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NHP2Q9NX24 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHP2Q9NX24 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHP2Q9NX24 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHP2Q9NX24 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms