Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20AQ9NP66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMG20AQ9NP66 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMG20AQ9NP66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMG20AQ9NP66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20AQ9NP66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMG20AQ9NP66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20AQ9NP66 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMG20AQ9NP66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMG20AQ9NP66 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms