Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABEP2Q9H5N1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABEP2Q9H5N1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABEP2Q9H5N1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP2Q9H5N1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABEP2Q9H5N1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABEP2Q9H5N1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RABEP2Q9H5N1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms