Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXN6

SPANXD, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome D, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXDQ9BXN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXDQ9BXN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXDQ9BXN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXDQ9BXN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXDQ9BXN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXDQ9BXN6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPANXDQ9BXN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPANXDQ9BXN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPANXDQ9BXN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPANXDQ9BXN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SPANXDQ9BXN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPANXDQ9BXN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms