Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA4Q9BXL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA4Q9BXL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDCA4Q9BXL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA4Q9BXL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA4Q9BXL8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA4Q9BXL8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA4Q9BXL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms