Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC4

MLST8, Target of rapamycin complex subunit LST8, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLST8Q9BVC4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MLST8Q9BVC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MLST8Q9BVC4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLST8Q9BVC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MLST8Q9BVC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLST8Q9BVC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MLST8Q9BVC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MLST8Q9BVC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLST8Q9BVC4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLST8Q9BVC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLST8Q9BVC4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLST8Q9BVC4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MLST8Q9BVC4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms