Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22CQ9BRL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms