Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TXNDC17Q9BRA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TXNDC17Q9BRA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TXNDC17Q9BRA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TXNDC17Q9BRA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TXNDC17Q9BRA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms