Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOXF2Q9BQY4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOXF2Q9BQY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOXF2Q9BQY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHOXF2Q9BQY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOXF2Q9BQY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RHOXF2Q9BQY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOXF2Q9BQY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RHOXF2Q9BQY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RHOXF2Q9BQY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHOXF2Q9BQY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RHOXF2Q9BQY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RHOXF2Q9BQY4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOXF2Q9BQY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms