Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKP2Q99959 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKP2Q99959 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP2Q99959 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKP2Q99959 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP2Q99959 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP2Q99959 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP2Q99959 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKP2Q99959 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP2Q99959 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms