Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMTM3Q96MX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTM3Q96MX0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTM3Q96MX0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMTM3Q96MX0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CMTM3Q96MX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM3Q96MX0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM3Q96MX0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM3Q96MX0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms