Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP6Q96FZ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP6Q96FZ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP6Q96FZ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP6Q96FZ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP6Q96FZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP6Q96FZ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP6Q96FZ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms