Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.351e-18■■■■■ 123.6
TBRG4Q969Z0 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 521.59■■□□□ 1.051e-18■■■■■ 123.6
TBRG4Q969Z0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 11e-18■■■■■ 123.6
TBRG4Q969Z0 RHOF-202ENST00000535560 670 ntTSL 518.58■□□□□ 0.561e-18■■■■■ 123.6
TBRG4Q969Z0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-18■■■■■ 123.6
TBRG4Q969Z0 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 516.12■□□□□ 0.171e-18■■■■■ 123.6
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TBRG4Q969Z0 P2RX4-213ENST00000543430 1436 ntTSL 520.84■□□□□ 0.939e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.919e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 TRMT1-222ENST00000593157 2127 ntTSL 220.09■□□□□ 0.819e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.779e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 KATNBL1-210ENST00000560108 853 ntTSL 518.96■□□□□ 0.639e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 KATNBL1-211ENST00000560247 1708 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.559e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 TRMT1-209ENST00000587633 648 ntTSL 317.14■□□□□ 0.339e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-208ENST00000456696 518 ntTSL 516.53■□□□□ 0.249e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.179e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.19e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.039e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 WWP2-207ENST00000566463 1971 ntTSL 214.81□□□□□ -0.041e-17■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.059e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.069e-14■■■■■ 117.7
TBRG4Q969Z0 TRMT1-220ENST00000592814 985 ntTSL 314.53□□□□□ -0.089e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 P2RX4-210ENST00000542067 1084 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.129e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.169e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.699e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.949e-14■■■■■ 117.7
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TBRG4Q969Z0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.689e-15■■■■■ 116.9
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TBRG4Q969Z0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.249e-15■■■■■ 116.9
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TBRG4Q969Z0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.419e-15■■■■■ 116.9
TBRG4Q969Z0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.299e-15■■■■■ 116.9
TBRG4Q969Z0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.259e-15■■■■■ 116.9
TBRG4Q969Z0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.019e-15■■■■■ 116.9
TBRG4Q969Z0 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.729e-15■■■■■ 116.9
TBRG4Q969Z0 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.493e-12■■■■■ 116.3
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TBRG4Q969Z0 FYTTD1-206ENST00000426031 491 ntTSL 319.63■□□□□ 0.731e-10■■■■■ 115.1
TBRG4Q969Z0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 115.1
TBRG4Q969Z0 FYTTD1-204ENST00000418169 593 ntTSL 510.12□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 115.1
TBRG4Q969Z0 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -11e-10■■■■■ 115.1
TBRG4Q969Z0 FYTTD1-207ENST00000428738 718 ntTSL 53.72□□□□□ -1.811e-10■■■■■ 115.1
TBRG4Q969Z0 FYTTD1-209ENST00000494309 719 ntTSL 53.05□□□□□ -1.921e-10■■■■■ 115.1
TBRG4Q969Z0 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.25□□□□□ -1.892e-9■■■■■ 114.9
TBRG4Q969Z0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-12■■■■■ 113.8
TBRG4Q969Z0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-12■■■■■ 113.8
TBRG4Q969Z0 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.267e-16■■■■■ 113.8
TBRG4Q969Z0 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.377e-16■■■■■ 113.8
TBRG4Q969Z0 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.171e-25■■■■■ 113.8
TBRG4Q969Z0 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 221.25■□□□□ 0.992e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.652e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-18■■■■■ 113.5
TBRG4Q969Z0 SEPT6-207ENST00000467310 1061 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-18■■■■■ 113.5
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