Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAPC3Q92966 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAPC3Q92966 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAPC3Q92966 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAPC3Q92966 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAPC3Q92966 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAPC3Q92966 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAPC3Q92966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC3Q92966 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAPC3Q92966 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms