Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCN1Q92616 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCN1Q92616 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCN1Q92616 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCN1Q92616 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCN1Q92616 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCN1Q92616 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCN1Q92616 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GCN1Q92616 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCN1Q92616 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCN1Q92616 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCN1Q92616 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCN1Q92616 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCN1Q92616 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCN1Q92616 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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