Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PYDC1Q8WXC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PYDC1Q8WXC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PYDC1Q8WXC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PYDC1Q8WXC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PYDC1Q8WXC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PYDC1Q8WXC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PYDC1Q8WXC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PYDC1Q8WXC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PYDC1Q8WXC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms