Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWM9

CYGB, Cytoglobin, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGBQ8WWM9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYGBQ8WWM9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYGBQ8WWM9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYGBQ8WWM9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYGBQ8WWM9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYGBQ8WWM9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYGBQ8WWM9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYGBQ8WWM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYGBQ8WWM9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYGBQ8WWM9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYGBQ8WWM9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYGBQ8WWM9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYGBQ8WWM9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYGBQ8WWM9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYGBQ8WWM9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYGBQ8WWM9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYGBQ8WWM9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYGBQ8WWM9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYGBQ8WWM9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYGBQ8WWM9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYGBQ8WWM9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYGBQ8WWM9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYGBQ8WWM9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYGBQ8WWM9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYGBQ8WWM9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms