Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFT2D1Q8WV19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFT2D1Q8WV19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFT2D1Q8WV19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFT2D1Q8WV19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFT2D1Q8WV19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFT2D1Q8WV19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D1Q8WV19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFT2D1Q8WV19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D1Q8WV19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms