Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP18Q8NEJ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DUSP18Q8NEJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP18Q8NEJ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DUSP18Q8NEJ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DUSP18Q8NEJ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DUSP18Q8NEJ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUSP18Q8NEJ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUSP18Q8NEJ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP18Q8NEJ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP18Q8NEJ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP18Q8NEJ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP18Q8NEJ0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP18Q8NEJ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP18Q8NEJ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms