Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETD9Q8NE22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETD9Q8NE22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD9Q8NE22 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD9Q8NE22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD9Q8NE22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SETD9Q8NE22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SETD9Q8NE22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD9Q8NE22 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD9Q8NE22 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD9Q8NE22 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD9Q8NE22 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD9Q8NE22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms