Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC197Q8NCU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC197Q8NCU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC197Q8NCU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC197Q8NCU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC197Q8NCU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC197Q8NCU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC197Q8NCU1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC197Q8NCU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms