Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C4

TMEM217, Transmembrane protein 217, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM217Q8N7C4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM217Q8N7C4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM217Q8N7C4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM217Q8N7C4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM217Q8N7C4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM217Q8N7C4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM217Q8N7C4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM217Q8N7C4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM217Q8N7C4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms