Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00337Q8N6G1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00337Q8N6G1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00337Q8N6G1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00337Q8N6G1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00337Q8N6G1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00337Q8N6G1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms