Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ0

CLVS1, Clavesin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1Q8IUQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLVS1Q8IUQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLVS1Q8IUQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLVS1Q8IUQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLVS1Q8IUQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLVS1Q8IUQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLVS1Q8IUQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLVS1Q8IUQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLVS1Q8IUQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms