Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRIG3Q6UXM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRIG3Q6UXM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRIG3Q6UXM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRIG3Q6UXM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRIG3Q6UXM1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIG3Q6UXM1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIG3Q6UXM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRIG3Q6UXM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRIG3Q6UXM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRIG3Q6UXM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRIG3Q6UXM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRIG3Q6UXM1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRIG3Q6UXM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms