Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GKAP1Q5VSY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GKAP1Q5VSY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKAP1Q5VSY0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GKAP1Q5VSY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GKAP1Q5VSY0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GKAP1Q5VSY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GKAP1Q5VSY0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GKAP1Q5VSY0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms