Protein–RNA interactions for Protein: Q5K131

CLLU1, Chronic lymphocytic leukemia up-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLLU1Q5K131 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLLU1Q5K131 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLLU1Q5K131 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLLU1Q5K131 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLLU1Q5K131 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLLU1Q5K131 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLLU1Q5K131 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLLU1Q5K131 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms