Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP20-1Q3LI63 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP20-1Q3LI63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP20-1Q3LI63 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP20-1Q3LI63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP20-1Q3LI63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP20-1Q3LI63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP20-1Q3LI63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP20-1Q3LI63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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