Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms