Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRF1Q16656 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRF1Q16656 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NRF1Q16656 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRF1Q16656 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRF1Q16656 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRF1Q16656 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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