Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX1Q16384 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSX1Q16384 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSX1Q16384 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX1Q16384 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSX1Q16384 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX1Q16384 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX1Q16384 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX1Q16384 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX1Q16384 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX1Q16384 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX1Q16384 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSX1Q16384 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX1Q16384 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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